Rica y diversa. En el país existen más de 300 áreas protegidas que ocupan aproximadamente el 22 por ciento del territorio nacional. Cuba atesora cuatro zonas declaradas por la UNESCO como Reservas De la Biosfera: la Península de Guanacahabibes y la Sierra del Rosario, en el occidente, el Parque Baconao y las Cuchillas del Toa, en el oriente del país. Más del 50 por ciento de la flora insular es endémica, también es elevado ese índice en los vertebrados.

En Cuba hay joyas de la naturaleza. Por ejemplo, la ranita más pequeña del mundo (Sminthillus limbatus), el murciélago mariposa más pequeño (Natalus lepidus), y el zunzuncito (Mellisuga helenae) conocido en México como "Chupa flor", el ave más diminuta; existen especies del género Polymita, consideradas entre los más bellos moluscos terrestres.

El cocodrilo Rhombifer, de los más primitivos del mundo; el almiquí y el manjuarí, clasificados ambos como fósiles vivientes (el primero del medio terrestre y el segundo del acuático) son, de igual manera, rarezas del rico patrimonio de la fauna cubana.

Cuba cuenta con una amplia variedad de vegetación tropical. En la parte oriental se encuentran grandes extensiones densamente cubiertas por bosques. La especie de árbol predominante es la palma, de la que Cuba posee más de 30 especies endémicas, destacando la palma real. Otras especies de la flora autóctona son: pino, caoba, ébano, encina y mangle. Entre los árboles y plantas frutales destacan el banano y los cítricos.

Uno de los mamíferos terrestres nativos es la jutía o almiquí. En la isla se encuentran un gran número de murciélagos y cerca de 300 especies de aves, en especial rabijunco, cayama, catey o periquito de Cuba, flamenco, grulla, loro, zunzuncito y otros. Entre los escasos reptiles de la isla se encuentran la tortuga, la iguana, el cocodrilo y una especie de boa que puede alcanzar los 3,7 m de longitud. En las aguas cubanas hay más de 700 especies de peces y crustáceos.

Cuba cuenta con numerosos parques nacionales repartidos por todo su territorio nacional, que presentan abundante flora y fauna. Algunos de ellos son: Baitiquiri-Cajobabo, Ciénaga de Lanier, El Faro, La Güira, Pico de Potrerillo y Valle de Viñales. En el año 2000 existían 206 especies en peligro de extinción.